School Submarine Fleet: Mermaid Girls

Una forma de vida extraterrestre conocida como Trench Walkers se ha revelado, emergiendo de la Antártida y caminando por el fondo del mar.
Su objetivo es terraformar la Tierra a su gusto, lo cual implica elevar el nivel del mar en 70 metros, haciendo que Tokio y muchos otros centros de población sean inhabitables.
También han comenzado a transformar el agua superficial de la Tierra en lo que llaman Néctar, el "agua divina".
Aquellos que son incompatibles con el Néctar tienen una gran posibilidad de morir al absorberlo.
Sin embargo, existen chicas que son compatibles con el Néctar, y ellas son reclutadas para ser marines en una lucha contra los Trench Walkers, embarcándose en naves para combatir en una nueva línea de frente en las profundidades marítimas.
La historia gira en torno a Hiro Todoroki, quien recibe un mensaje de una hermana mayor, una marine supuestamente desaparecida en combate.
El mensaje dice que Hiro debe encontrar a una formidable marine llamada Kiriri Tsunoba.
Aunque perdida y confundida, Hiro se dirige a la Unidad Submarina de la Masakado Girls Academy con la intención de unirse a ellas.